গণপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকারের শিক্ষা মন্ত্রণালয় কর্তৃক গঠিত একটি উচ্চ ক্ষমতা সম্পন্ন বোর্ড অব গভর্নরস কলেজটি পরিচালনার দায়িত্বে রয়েছেন। কলেজের বোর্ড অব গভর্নরস এর সংগঠন নিম্নরূপ :
সভাপতি
সচিব, মাধ্যমিক ও উচ্চ শিক্ষা বিভাগ, শিক্ষা মন্ত্রণালয়, গণপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকার, বাংলাদেশ সচিবালয়, ঢাকা ।
সহ–সভাপতি
বিভাগীয় কমিশনার, খুলনা বিভাগ।
সদস্যবৃন্দ
১. কমিশনার, খুলনা মেট্রোপলিটন পুলিশ।
২. প্রধান প্রকৌশলী, শিক্ষা প্রকৌশল অধিদপ্তর, ঢাকা।
৩. চেয়ারম্যান, মাধ্যমিক ও উচ্চ মাধ্যমিক শিক্ষা বোর্ড, যশোর।
৪. পরিচালক (কলেজ ও প্রশাসন) মাধ্যমিক ও উচ্চ মাধ্যমিক শিক্ষা অধিদপ্তর, ঢাকা ।
৫. যুগ্ম-সচিব (প্রশাসন) অর্থ বিভাগ, অর্থ মন্ত্রণালয়, গণপ্রজাতন্ত্রী বাংলাদেশ সরকার, বাংলাদেশ সচিবালয়, ঢাকা।
৬. প্রধান নির্বাহী কর্মকর্তা, খুলনা সিটি কর্পোরেশন, খুলনা ।
৭. জেলা প্রশাসক, খুলনা জেলা।
৮. বিদ্যোৎসাহী সদস্য-১জন।
৯. শিক্ষক প্রতিনিধি- ২জন (প্রভাতী-১জন, দিবা-১জন)
সদস্য সচিব
অধ্যক্ষ, খুলনা পাবলিক কলেজ, খুলনা ।